高新技術企業使用的會計科目與普通企業使用的會計科目基本相同，所不同的是高新技術企業要做好研發費用歸集的賬務處理。研發費用歸集首先要進行研發項目立項，根據研發項目立項RD設置研發費用項目輔助核算科目，以用友軟件U8為例設置高新技術企業會計科目具體操作如下：

步驟一：進入用友U8-總賬，系統菜單--設置--編碼檔案--項目目錄（設置RD項目核算）。如下圖所示：

步驟二：項目檔案---項目大類---項目管理---項目分類定義---增加“分類名稱”（即項目名稱）。如下圖所示：

步驟三：項目檔案---項目大類----項目管理---維護。如下圖所示：

步驟四：項目目錄維護---增加（項目名稱）---設置完工日期，項目設置己完成。如下圖所示：

步驟五：設置會計科目---成本---研發支出--研發費用化支出（設置一級科目）---勾選“項目核算”。如下圖所示：

步驟六：設置會計科目---成本---研發支出--研發費用化支出----增加二級科目（如：研發人員費用、直接投入費用、折舊費用、長期待攤費用、無形資產攤銷費用、設計費用、裝備調式費用與試驗費用、委托外部研究費用、其他費用）--勾選“項目核算”。如下圖所示：

步驟七：設置會計科目---成本---研發支出--研發費用化支出----在研發人員工資及五險一金下增加三級科目（如：工資、福利費、養老保險、失業、工傷、生育、醫療、公積金）--勾選“項目核算”。如下圖所示：

步驟八：設置會計科目--損益---主營業務收入----高新收入（設置一級科目）。如下圖所示：

步驟九：系統菜單--編碼檔案--項目目錄-項目大類--項目管理---核算科目---待選科目---全選到己選科目-確定。高新企業科目設置完成。如下圖所示：

注意：根據新的會計準則，高新企業產生的研發費用需要通過成本類科目“研發支出”進行歸集，不符合資本化條件時從“研發支出”結轉到損益類科目“管理費用---研發費用”下。